Федеральная служба безопасности Российской Федерации является головным субъектом, проводящим мероприятия по пресечению террористической деятельности, осуществляющим борьбу с терроризмом посредством предупреждения, выявления и пресечения преступлений террористического характера, а также посредством предупреждения, выявления и пресечения международной террористической деятельности, в соответствии с уголовно-процессуальным законодательством проводит предварительное расследование уголовных дел о таких преступлениях, решая следующие задачи:

• выявление террористических групп и отдельных террористов;
• предупреждение деятельности отдельных террористов и террористических групп;
• разоружение незаконных вооруженных формирований и бандформирований, прекращение их деятельности;
• поиск и прекращение деятельности главарей незаконных вооруженных формирований, их задержание;
• поиск и ликвидация лагерей незаконных вооруженных формирований, крупногабаритных тайников;
• поиск и ликвидация подпольных предприятий, обеспечивающих деятельность террористических организаций;
• задержание и ликвидация караванов с оружием, материально-техническими и финансовыми средствами, предназначенными для террористических групп и организаций;
• участие в пределах своей компетенции в защите объектов от террористических устремлений;
• освобождение захваченных террористами заложников;
• освобождение захваченных террористами зданий органов государственной власти Российской Федерации, общественных организаций, дипломатических и консульских представительств иностранных государств, а также представительств зарубежных и международных организаций на территории России;
• пресечение террористических акций на стратегических объектах;
• участие в обеспечении физической безопасности должностных лиц, подлежащих государственной защите;
• обеспечение физической безопасности оперативного состава, членов их семей от покушений со стороны террористических структур, отдельных террористов;
• обеспечение физической безопасности лиц, сотрудничающих на конфиденциальной основе с органами безопасности, членов их семей, а также свидетелей, участвующих в уголовных процессах по делам о преступлениях террористического характера. 

В зависимости от опасности террористических угроз и вероятных последствий, масштабов проведения специальных операций управление ими может осуществляться на федеральном, региональном (в пределах федерального округа) уровнях и уровне субъекта Российской Федерации.

Министерство внутренних дел Российской Федерации решает следующие задачи:

• организует и проводит комплексные предупредительно-профилактические мероприятия антитеррористического характера, включая перекрытие каналов поступления террористическим группам финансовых средств, оружия, боеприпасов, взрывных устройств, других средств поражения;
• организует взаимодействие с субъектами антитеррористической деятельности;
• организует и осуществляет силами ОВД выявление и устранение причин, способствующих подготовке и совершению преступлений террористического характера;
• разрабатывает и реализует планы ОВД по предупреждению преступлений террористического характера;
• организует розыск лиц, совершивших преступления террористического характера, уклоняющихся от следствия и суда;
• организует информирование населения и средств массовой информации о состоянии и мерах по борьбе с преступлениями террористического характера. 

В кризисных ситуациях террористического характера МВД России (в соответствии с компетенцией, определенной действующим законодательством) во взаимодействии с другими федеральными органами исполнительной власти выполняет следующие задачи:

• пресечение и ликвидация последствий террористических акций (совместно с ФСБ России, Минобороны России, МЧС России, Минздравом России и другими привлекаемыми ведомствами);
• ликвидация незаконных вооруженных формирований (совместно с Минобороны России, ФСБ России, Минздравом России и другими привлекаемыми ведомствами);
• освобождение заложников (совместно с ФСБ России, Минобороны России, МЧС России, Минздравом России и другими привлекаемыми ведомствами);
• участие в предотвращении и пресечении вооруженного мятежа (совместно с ФСБ России, Минобороны России и другими привлекаемыми ведомствами);
• предупреждение и пресечение захвата важных объектов (совместно с Минобороны России, ФСБ России, Минтрансом России, Минпромторгом России и другими привлекаемыми ведомствами). Служба внешней разведки Российской Федерации обеспечивает безопасность учреждений Российской Федерации, находящихся за пределами России, их сотрудников и членов их семей; осуществляет сбор информации о деятельности иностранных и международных террористических организаций. 

Федеральная служба охраны Российской Федерации выполняет следующие функции:

• прогнозирует и выявляет угрозы жизненно важным интересам объектов государственной охраны, осуществляет комплекс мер по предотвращению этой угрозы;
• обеспечивает безопасность объектов государственной охраны в местах постоянного и временного пребывания и на трассах проезда;
• обеспечивает в пределах своих полномочий организацию и функционирование президентской связи;
• участвует в пределах своих полномочий в борьбе с терроризмом;
• защищает охраняемые объекты;  
• выявляет, предупреждает и пресекает преступления и иные правонарушения на охраняемых объектах. 

Министерство обороны Российской Федерации организует подготовку и использование сил и средств в случае террористического акта в воздушном пространстве и в территориальных водах Российской Федерации, обеспечивает защиту от террористических посягательств объектов Вооруженных сил Российской Федерации, вооружения и боеприпасов, находящихся на вооружении или на хранении в войсковых частях, участвует в проведении контр террористических операций на военных объектах и в случае возникновения масштабных террористических угроз безопасности государства.

В целях недопущения террористических актов воинские части и подразделения Вооруженных сил Российской Федерации могут привлекаться для решения следующих задач: 

• проведение комплекса мероприятий по профилактике и предупреждению возможных террористических актов на военных объектах;
• усиление охраны и обороны складов, баз, арсеналов с вооружением и боеприпасами, жилых зон военных городков, казарм и т.д.;
• контроль в зонах ответственности;
• проведение тренировок по обеспечению безопасности объектов инфраструктуры и жизнедеятельности войск;
• поддержка других силовых структур при организации противодействия террористическим группам и организациям;
• поиск и обезвреживание взрывоопасных предметов.